SV Waidhofen/Thaya is een Oostenrijkse voetbalclub uit Waidhofen an der Thaya. De club werd opgericht in 1945. De clubkleuren zijn blauw en geel. SV Waidhofen/Thaya speelt haar thuiswedstrijden in het Sparkassenstadion.

De club promoveerde in 2018 naar de Regionalliga Ost, het derde niveau in het Oostenrijkse voetbal. In het seizoen 2019/20 eindigde SV Waidhofen/Thaya op de derde plaats in de Regionalliga Ost.

Enkele bekende spelers die voor SV Waidhofen/Thaya hebben gespeeld, zijn:

* Thomas Stadler
* Christian Gratzei
* Thomas Piermayr

De huidige trainer van SV Waidhofen/Thaya is Michael Blümel.